دوره آموزشی غیرحضوری شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD - پیشرفته

دوره آموزشی غیرحضوری شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD - پیشرفته
 
  • تاریخ درج ۱۳۹۹/۰۴/۱۰
  • تعداد بازدید 25,387
 
موضوع

آموزش غیرحضوری
 
 
امتیاز کاربران

امتیاز از ۵ (۰ رای)

 
 
 

دوره آموزشی غیرحضوری شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD - پیشرفته


سایت آموزش فناوری نانو، دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته» با تدریس مهندس واعظی را برگزار می‌نماید. این دوره شامل 4 ساعت ویدیوی آموزشی است. شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد شوند، گواهی پایان دوره الکترونیکی (فارسی و انگلیسی) را دریافت می‌کنند.

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی در مقیاس نانو (NAMD) یک نرم‌افزار کامپیوتری برای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی است که با استفاده از مدل برنامه‌نویسی موازی ++Charm نوشته شده است؛ با توجه به بازده موازی و کارایی بالای این نرم‌افزار، اغلب از آن برای شبیه‌سازی سیستم‌های بزرگ (شامل میلیون‌ها اتم) و سیستم‌های بیومولکولی استفاده می‌شود. این نرم‌افزار در سال 1995 توسط نلسون و همکارانش به عنوان برنامه دینامیک مولکولی موازی ارائه شد که در کنار برنامه گرافیکی VMD قادر به شبیه‌سازی بود.

VMD برای مدلسازی، تجسم و تجزیه و تحلیل سیستم‌های زیستی نظیر پروتئین‌ها، نوکلئیک اسیدها و لایه‌های لیپیدی طراحی شده است؛ از آنجایی که این نرم‌افزار می‌تواند فایل‌های بانک داده پروتئین استاندارد (PDB) را بخواند و ساختار دربرگیرنده آن‌ها را نمایش دهد، می‌توان از آن برای مولکول‌های متداول‌تر نیز استفاده کرد. VMD از روش‌های مختلفی برای نمایش و رنگ‌آمیزی مولکول‌ها استفاده می‌کند و می‌تواند برای متحرک‌سازی و آنالیز شبیه‌سازی دینامیک مولکولی نیز استفاده شود. به صورت خاص این نرم‌افزار به عنوان نمای گرافیکی یک برنامه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی استفاده می‌شود و قادر است تحرک مولکول را تحت شرایط شبیه‌سازی به صورت متحرک به نمایش درآورد.


سایت آموزش فناوری نانو، دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته» با تدریس آقای مهندس مهران واعظی را برگزار می‌نماید؛ این دوره شامل 4 ساعت ویدیو آموزشی است.

** شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد شوند، گواهی پایان دوره الکترونیکی (فارسی و انگلیسی) را دریافت می‌کنند.

***با توجه به اینکه این دوره شامل 4 ساعت ویدیو آموزشی است، هزینه ثبت‌نام در این دوره، 316 هزار تومان است.

نام دوره

مدرس

هزینه دوره گواهی پایان‌دوره الکترونیکی ثبت‌نام
شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته آقای مهندس مهران واعظی 316 هزار تومان  دارد ثبت‌نام


 

 

آقای مهندس مهران واعظی

* دانشجوی دکتری فناوری نانو در پژوهشکده علوم و فناوری نانو دانشگاه صنعتی شریف

* دارای مدرک کارشناسی و کارشناسی ارشد فیزیک از دانشگاه صنعتی شریف

* سابقه تدریس نرم‌افزارهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (NAMD و LAMMPS) در دانشگاه شریف

* سابقه پژوهشی در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی


 

1- آشنایی با کاربردهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

2- آشنایی با مبانی شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

3- آموزش نرم‌افزار VMD

4- آموزش طراحی کانال غشایی توسط نرم‌افزار VMD

5- آموزش پیاده‌سازی شبیه‌سازی با استفاده از نرم‌افزار NAMD

6- آموزش نحوه استخراج داده‌های خروجی و نحوه تحلیل داده‌ها

7- آموزش شبیه‌سازی SMD

8- بررسی عبور یون از کانال پروتئینی توسط شبیه‌سازی SMD

9- تحلیل داده‌های خروجی و محاسبه تغییرات انرژی آزاد


 

 

برای کسب اطلاعات بیشتر درباره دوره با شماره‌  09104712036 تماس حاصل فرمایید.

ارسال نظر

 
تعداد نظرات : ۱

  • Saeid Afshar

    ۱۴۰۰/۰۵/۱۲
    سلام آیا دوره جدیدی در این زمینه برگزار خواهد شد سپاس

    مدیر سیستم

    ۱۴۰۰/۰۵/۱۶
    با سلام
    در صورت امکان دوره‌های جدید در این موضوع را برگزار خواهیم کرد. اخبار سایت را دنبال کنید.
    موفق باشید