دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی داکینگ مولکولی (تئوری و کار با نرم‌افزار)»
دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی داکینگ مولکولی (تئوری و کار با نرم‌افزار)»
دوره آموزشی غیرحضوری جامع «شبیه‌سازی داکینگ مولکولی (تئوری و کار با نرم‌افزار)» با تدریس جناب آقای حمزه صالح‌زاده در سایت آموزش فناوری نانو در اختیار کاربران قرار می‌گیرد. این دوره شامل 15 ساعت محتوای آموزشی است و علاقه‌مندان پس از ثبت‌نام در دوره، به محتوای دوره دسترسی خواهند داشت. گفتنی است محتوای دوره از طریق بستر سایت آموزش قابل استفاده است و دسترسی به دوره محدودیت زمانی ندارد. آزمون پایان دوره پس از اتمام مراحل آموزشی و در صفحه دوره برگزار می‌شود و شرکت در آن محدودیت زمانی ندارد. شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد شوند، گواهی پایان دوره (فارسی و انگلیسی) را به صورت الکترونیکی دریافت می‌کنند.
امروزه کامپیوتر در زیست‌شناسی کاربردهای فراوانی پیدا کرده است؛ یکی از مهم‌ترین این کاربردها برهمکنش مولکول‌هاست که با نام علمی داکینگ مولکولی شناخته می‌شود. در داکینگ ابتدا به این موضوع پرداخته خواهد شد که آیا دو مولکول می‌توانند اینتراکشن داشته باشند؟ و اگر می‌توانند در چه حالتی این مولکول‌ها می‌توانند بیشترین اینتراکشن و کمترین انرژی ممکن را با هم داشته باشند؟ در داکینگ مهم‌ترین اینتراکشن‌هایی که به دنبال آن هستیم پیوندهای هیدروژنی هستند. داکینگ همچنین پرکاربردترین ابزار در طراحی محاسباتی دارو است. این روش صحیح‌ترین روش برای پیشگویی ترکیبات ویژه جهت انجام یا مهار اینتراکشن است. به همین علت شرکت‌های داروسازی، تعداد بسیار زیادی از ترکیبات را توسط داکینگ تحلیل می‌کنند و در صورت نیاز، ترکیبات با بهترین نتیجه داکینگ سنتز شده و در آزمایشگاه تحلیل می‌شود. بنابراین روش داکینگ نقش مهمی در تحقیقات دارویی ایفا می‌کند و می‌تواند روشی سودمند و با صرفه اقتصادی (کاهش تعداد آزمایشات و صرفه‌جویی در زمان و هزینه) در فرآیند طراحی دارو باشد. فرآیند داکینگ شامل تعیین جهت‌گیری، ساختار هندسی کنفورماسیونی و رتبه‌بندی است که رتبه‌بندی معیار اندازه‌گیری انرژی اتصال یا انرژی آزاد است.
اطلاعات دوره آموزشی غیرحضوری شبیه‌سازی داکینگ مولکولی |
|
| عنوان دوره | شبیه‌سازی مولکولی؛ تئوری و کار با نرم‌افزار |
| مدرس دوره | جناب آقای حمزه صالح‌زاده |
| مدت زمان دوره | 15 ساعت |
| نوع محتوای دوره | ویدیو، متن و آزمون |
| زمان دسترسی به محتوای دوره | - بلافاصله پس از ثبت‌نام از طریق صفحه رویداد در سایت آموزش - 24 ساعت پس از پرداخت از طریق آیدی‌پی |
| مدت زمان دسترسی به دوره | نامحدود |
| نحوه شرکت در آزمون | - به صورت آنلاین و پس از گذراندن مراحل آموزشی در صفحه دوره - بدون محدودیت زمانی |
| وضعیت گواهی | الکترونیکی؛ (فارسی و انگلیسی) |
| حدنصاب درصد کسب شده در آزمون جهت دریافت گواهی پایان دوره | 50 درصد |
| هزینه دوره | 489 هزار تومان |
| اطلاعات بیشتر و ثبت‌نام از طریق سایت آموزش | ثبت‌نام |
| ثبت‌نام از طریق زرین‌پال | ثبت‌نام |
نکات مهم:
- گواهی پایان دوره الکترونیکی، بلافاصله پس از کسب حدنصاب در آزمون در سایت و از طریق بخش رویدادهای من قابل مشاهده و دریافت است.
- محتوای دوره از طریق بستر سایت آموزش قابل استفاده است.
ابتدا وارد بستر جدید سایت آموزش فناوری نانو شوید (در صورتی که عضو سایت نیستید، ابتدا در سایت عضو شوید: عضویت در سایت)؛ پس از ورود به سایت، در دوره مدنظر خود ثبت‌نام کنید. برای دسترسی به دوره ثبت‌نامی خود، کافی است وارد سایت شوید و بر روی نام کاربری خود کلیک کنید؛ با ورود به بخش رویدادهای من، به دوره ثبت‌نامی خود دسترسی خواهید داشت.
جناب آقای حمزه صالح‌زاده
- دانشجوی دکترای تخصصی مهندسی بهداشت محیط دانشگاه علوم پزشکی کردستان
- مؤلف، مترجم و همکاری در تألیف و ترجمه چندین کتاب در حوزه سم‌شناسی و بهداشت
- نخبه کشوری وزارت بهداشت
- برنده جایزه بنیاد البرز
- پژوهشگر در زمینه سم‌شناسی و بهداشت
1- مقدمه‌ای بر داکینگ مولکولی
2- محیط‌های in vivo, in vitro, in silico
3- داکینگ وهدف از طراحی دارو
4- شناسایی مولکولی
5- تعریف داکینگ مولکولی
7- انواع داکینگ
8- باندینگ مد (Pose)
9- طراحی داروی جدید
10- عوامل مؤثر برداکینگ (عوامل داخل مولکولی و بین‌مولکولی)
11- نقش برهمکنش‌ها
12- آشنایی با رسپتور و لیگاند
14- نمایشگر مولکولی
15- انواع امتیاز دهی به نرم افزارهای داکینگ مولکولی
16- الگوریتم های جستجو
17- دیتابیس های مواد شیمیایی (آشنایی و استفاده)
19- آماده‌سازی رسپتور
20- نرم‌افزارهای داکینگ مولکولی (آموزش دانلود، نصب، توضیحات ضروری و نحوه استفاده)
22- ساخت فایل Pdbqt با AutoDock
23- ساخت grid و فایل gpf با AutoDock
24- دستورها و اصول داکینگ
25- آنالیز خروجی
26- نرم‌افزار AutoDock Vina (دانلود، نصب، توضیحات ضروری، آماده‌سازی لیگاند و رسپتور، کار با نرم‌افزار، آنالیز خروجی)
27- انجام چند مورد داکینگ
28- تفسیر نتایج با Ligplot
29- بررسی چند مورد از مقالات داکینگ مولکولی نانوذرات
30- آشنایی با نرم‌افزار Molegro Virtual Docker جهت داکینگ مولکولی (دانلود، نصب نرم‌افزار، توضیحات ضروری و کار با نرم‌افزار)
31- ساختارهای ورودی نرم‌افزار Molegro Virtual Docker (ساختار پروتئین و ساختارهای سه بعدی مورد نیاز لیگاند)
32- آماده‌سازی ساختار پروتئین
33- آماده‌سازی لیگاند
2- محیط‌های in vivo, in vitro, in silico
3- داکینگ وهدف از طراحی دارو
4- شناسایی مولکولی
5- تعریف داکینگ مولکولی
- مدل‌های داکینگ مولکولی
- روش‌های تجربی
7- انواع داکینگ
8- باندینگ مد (Pose)
9- طراحی داروی جدید
10- عوامل مؤثر برداکینگ (عوامل داخل مولکولی و بین‌مولکولی)
11- نقش برهمکنش‌ها
12- آشنایی با رسپتور و لیگاند
- دستیابی به ساختار لیگاند
- بهینه سازی ساختا
- دستیابی به ساختار رسپتورها (Targets)
- شرایط Targets
14- نمایشگر مولکولی
15- انواع امتیاز دهی به نرم افزارهای داکینگ مولکولی
16- الگوریتم های جستجو
17- دیتابیس های مواد شیمیایی (آشنایی و استفاده)
- دیتابیس Pubchem
- دیتابیس ChemSpider
- دیتابیس drugbank
- دیتابیس RCSB-PDB
- دیتابیس UniPort
- دریافت ساختار پروتئین‌ها
- بهینه سازی ساختار
- غربالگری لیگاندها
- کار با سرور Swiss ADME
19- آماده‌سازی رسپتور
20- نرم‌افزارهای داکینگ مولکولی (آموزش دانلود، نصب، توضیحات ضروری و نحوه استفاده)
- نرم‌افزار ADT
- نرم‌افزار Chemoffice
- نرم‌افزار Gaussian
- نرم افزار Viewerlite
- نرم افزار Notepad++
- نرم افزار Open Babel
- نرم افزار LigPlot+
- نرم افزار discovery studio
- نرم افزار Python Molecule Viewer
- نرم افزار AutoDock
22- ساخت فایل Pdbqt با AutoDock
23- ساخت grid و فایل gpf با AutoDock
24- دستورها و اصول داکینگ
25- آنالیز خروجی
26- نرم‌افزار AutoDock Vina (دانلود، نصب، توضیحات ضروری، آماده‌سازی لیگاند و رسپتور، کار با نرم‌افزار، آنالیز خروجی)
27- انجام چند مورد داکینگ
28- تفسیر نتایج با Ligplot
29- بررسی چند مورد از مقالات داکینگ مولکولی نانوذرات
30- آشنایی با نرم‌افزار Molegro Virtual Docker جهت داکینگ مولکولی (دانلود، نصب نرم‌افزار، توضیحات ضروری و کار با نرم‌افزار)
31- ساختارهای ورودی نرم‌افزار Molegro Virtual Docker (ساختار پروتئین و ساختارهای سه بعدی مورد نیاز لیگاند)
32- آماده‌سازی ساختار پروتئین
33- آماده‌سازی لیگاند
برای ثبت‌نام در این دوره دو راه وجود دارد:
1- ثبت‌نام از طریق پلتفرم جدید سایت آموزش فناوری نانو: علاقه‌مندانی که تمایل دارند در این دوره شرکت کنند، می‌توانند به پلتفرم جدید سایت آموزش فناوری نانو مراجعه کنند و پس از ثبت‌نام در سایت، از طریق لینک زیر در دوره ثبت‌نام کنند:
2- مراجعه به لینک زیر:
علاقه‌مندانی که از طریق لینک پرداخت زرین‌پال در دوره ثبت‌نام می‌کنند، 24 ساعت پس از ثبت‌نام، دسترسی این افراد به دوره در پلتفرم جدید سایت آموزش ایجاد شده و به اطلاع ایشان خواهد رسید.
تصویر نمونه گواهی‌های پایان‌دوره در ادامه قابل مشاهده است:
برای کسب اطلاعات بیشتر درباره دوره با شماره 09104712036 تماس حاصل فرمایید.
آنیتا
۱۴۰۳/۰۷/۱۷سلام آیا دوره همچنان برقراره؟
مدیر سیستم
۱۴۰۳/۰۷/۱۹سلام وقت شما بخیر
بله، این دوره به صورت ویدئوهای ضبط شده‌است.
فرزاد ملک
۱۴۰۱/۰۳/۲۸مدیر سیستم
۱۴۰۱/۰۳/۲۸بله این دوره فعال هست.
نجمه رضایی
۱۴۰۱/۰۳/۰۴مدیر سیستم
۱۴۰۱/۰۳/۰۴بله، درست است
مرتضی رضایی
۱۴۰۰/۱۲/۲۲مدیر سیستم
۱۴۰۰/۱۲/۲۲ممنون از شما
از طرف ستاد نانو تایید میشه. مهر و هولوگرام ستاد نانو روی گواهی خورده میشه
محبی
۱۴۰۰/۰۵/۲۴سلام،
دوره جذابی بود
مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۹/۱۰ممنون از حسن توجه شما
غفاری
۱۴۰۰/۰۴/۲۵مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۹/۱۰لطفا با بخش پشتیبانی سایت تماس بگیرید
Asgari
۱۴۰۰/۰۴/۱۹چرا این دوره جزو تخفیفات نیست؟ لطفا این دوره رو هم به لیست پیک پنجم اضافه کنید
مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۲۲این دوره به تازگی در سایت آموزش و با تخفیف ارائه شده بود. انشاالله در دوره‌های تخفیفی آینده این دوره ارائه خواهد شد.
نیک فرد
۱۴۰۰/۰۴/۱۸سلام من در تاریخ ۳۱ خرداد این دوره ثبت نام کردم و در بخش رویدادهای من دیده می شود اما امکان استفاده از کلاس های آموزشی فراهم نیست و فعال نشده است
مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۲۳جهت مشاهده دوره و مطابق با راهنمای سایت، در بخش رویدادهای من بر روی تصویر چشم در بخش مشاهده کلاس کلیک کنید تا به صفحه دوره منتقل شوید.
یوسفی
۱۴۰۰/۰۴/۰۷مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۰۷با سلام
این مورد را به تلگرام پشتیبانی اطلاع دهید
ساجده شکروی
۱۴۰۰/۰۴/۰۷مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۰۷زرین زاده
۱۴۰۰/۰۳/۲۸سلام خسته نباشید من روز چهارشنبه ۲۶ خرداد ثبت نام کردم ولی چیزی دریافت نکردم
مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۰۱دسترسی شما ایجاد شده است. در صورتی که از طریق زرین لینک در دوره ثبت نام کرده اید، 24 ساعت بعد دسترسی شما به دوره ایجاد خواهد شد. در صورتی که بیش از این زمان طول کشید با پشتیبانی سایت به شماره 09104712036 تماس گرفته یا به تلگرام این شماره پیام دهید.
کریم زاده
۱۴۰۰/۰۳/۲۷مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۳/۲۹سلام و روزبخیر
کارگاه آنلاین که صرفا معرفی دوره داکینگ بود رایگان و خود دوره با تخفیف ثبت‌نام زودهنگام (30 درصد) هست
بوربور
۱۴۰۰/۰۳/۲۶مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۰۱بعد از وارد شدن به حساب کاربریتون، روی اسمتان کلیک کنید و به قسمت رویدادهای من بروید، بعد از دیدن هر جلسه تایید و ادامه را بزنید تا جلسات بعدی برایتان باز شود
غفاریان زیرک
۱۴۰۰/۰۳/۲۲با سلام هزینه دوره خیلی بالاست. دست کم برای اعضای قدیمی ستاد و کسانیکه دوره های مختلفی رو شرکت کردن و آزمون دادن تخفیف در نظر بگیرین لطفا.
مدیر سیستم
۱۴۰۰/۰۴/۰۲تلاش ما در سایت آموزش بر این است تا با توجه به هزینه‌های آماده‌سازی دوره، قیمت دوره بر اساس امکان استفاده حداکثری مخاطبین تعیین شود و شرایط تهیه دوره با اختصاص تخفیف به مناسبت‌های مختلف برای علاقه‌منئدان تسهیل شود.