بسته جامع شبیه سازی دینامیک مولکولی NAMD VMD LAMMPS

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته

1- آشنایی با کاربردهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
2- آشنایی با مبانی شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
3- آموزش نرم‌افزار VMD
4- آموزش طراحی کانال غشایی توسط نرم‌افزار VMD
5- آموزش پیاده‌سازی شبیه‌سازی با استفاده از نرم‌افزار NAMD
6- آموزش نحوه استخراج داده‌های خروجی و نحوه تحلیل داده‌ها
7- آموزش شبیه‌سازی SMD
8- بررسی عبور یون از کانال پروتئینی توسط شبیه‌سازی SMD
9- تحلیل داده‌های خروجی و محاسبه تغییرات انرژی آزاد
 

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار LAMMPS

1- مبانی شبیه‌سازی با نرم‌افزار لمپس (قابلیت‌های نرم‌افزار LAMMPS، میدان‌های نیرو و پتانسیل‌ها، معرفی مفهوم atom style در نرم‌افزار لمپس، معرفی سیستم یکاها در لمپس، مفهوم جعبه شبیه‌سازی و شرایط مرزی، معرفی آنسامبل‌ها، کمینه‌سازی انرژی پتانسیل)
2- نصب نرم‌افزار و آموزش اجرای موازی و سری شبیه‌سازی
3- آموزش شبیه‌سازی سیستم‌های غیر زیستی(شبیه‌سازی نانو-ایندنتیشن کریستال طلا با پروب الماس)
4- آموزش شبیه‌سازی سیستم‌های زیستی(شبیه‌سازی برهمکنش نانوذره طلا و غشای سلولی)
 

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی NAMD/VMD&LAMMPS - تکمیلی

* دانشجوی دکتری فناوری نانو در پژوهشکده علوم و فناوری نانو دانشگاه صنعتی شریف
* فارغ‌التحصیل کارشناسی و کارشناسی ارشد فیزیک از دانشگاه صنعتی شریف
* سابقه تدریس نرم‌افزارهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (NAMD و LAMMPS) در دانشگاه شریف
* سابقه پژوهشی در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
 

جناب آقای مهندس امیر دشتی

*  کارشناسی ارشد مهندسی مواد گرایش استخراج فلزات از دانشگاه صنعتی شریف و دانشجوی دکتری مهندسی مواد پژوهشگاه مواد و انرژی
* مدرس دانشگاه
* تدریس، پژوهش و چاپ مقالات علمی در زمینه شبیه‌سازی با نرم‌افزارهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی، کوانتومی و ....
* تدریس، پژوهش و چاپ مقالات علمی در زمینه خوردگی، حفاظت و استخراج مواد
 

  دسترسی نامحدود به دوره

 عدم محدودیت زمانی برای شرکت در آزمون

(در ارتباط با شرکت در آزمون پایان‌دوره به نکات زیر دقت فرمایید:

• ترجیحا از سیستم/کامپیوتر و مرورگر فایرفاکس استفاده کنید.
• در حین آزمون، صفحه را رفرش نکنید و دکمه Back را نزنید.
• تب دیگری را در حین آزمون باز نکنید.
• هیچ آزمونی تحت عنوان آزمون آزمایشی وجود ندارد و در صورت کسب قبولی بالای 50% سیستم بطور خودکار بسته خواهد شد.
• تنها اولین آزمون شما، رایگان است و 4 بار دیگر امکان آزمون مجدد را خواهید داشت که با پرداخت هزینه همراه است. لازم به ذکر است، این 4 شانس مجدد تنها در صورت کسب نمره زیر 50 به صورت سیستمی به فرد داده خواهد شد.)

 ارائه گواهی الکترونیکی به صورت فارسی و انگلیسی پس از اتمام موفقیت آمیز دوره

 امکان مشاهده دوره آموزشی بلافاصله پس از پرداخت از طریق کیف پول

 

دوره‌های آموزشی غیرحضوری سایت آموزش فناوری نانو، در پلتفرم جدید سایت آموزش فناوری نانو قرار گرفته است. در ادامه نحوه ثبت‌نام و دسترسی به دوره، مشاهده دوره و شرکت در آزمون پایان دوره آورده شده است.

برای دسترسی به دوره، ترجیحاً از طریق مرورگر فایرفاکس آپدیت شده، ابتدا وارد لینک زیر شوید:

https://nanoeducation.ir

پس از ورود به لینک https://nanoeducation.ir، صفحه اول سایت را مشاهده خواهید کرد؛ پس از ورود به سایت، ابتدا در سایت ثبت‌نام کنید. دقت کنید، اطلاعات کاربری خود را جهت صدور گواهی، بطور کامل و صحیح وارد نمایید.

با تکمیل و تأیید فرم ثبت‌نام، ایمیل فعال‌سازی حساب کاربری برای شما ارسال خواهد شد؛ با تأیید لینک فعال‌سازی ارسال شده به ایمیل، عضو سایت خواهید شد.
 

پس از تکمیل ثبت‌نام، مجدد به سایت https://nanoeducation.ir مراجعه کنید و با استفاده از اطلاعات ثبت‌نامی خود وارد سایت شوید:

با اولین لاگین در پلتفرم جدید سایت آموزش فناوری نانو، 5000 تومان اعتبار اولیه هدیه به شما تعلق خواهد گرفت. بعد از ورود به سیستم و جهت افزایش موجودی کیف پول خود در سایت، برای ثبت‌نام در دوره آموزشی غیرحضوری مدنظر خود، بر روی گزینه موجودی در کنار نام کاربری خود کلیک کنید:

با کلیک بر روی گزینه موجودی، به صفحه پرداخت سایت منتقل می‌شوید و می‌توانید موجودی کیف پول خود را در سایت افزایش دهید:

پس از افزایش موجودی و جهت انتخاب دوره مدنظر خود و ثبت‌نام در دوره، به لینک زیر وارد شوید:

دوره‌های آموزشی غیرحضوری سایت آموزش فناوری نانو

با کلیک بر روی عنوان دوره مدنظر خود، به صفحه دوره منتقل می‌شوید و می‌توانید در دوره ثبت‌نام کنید:

پس از ثبت‌نام، دکمه ورود به کلاس برای شما فعال خواهد شد و می‌توانید به محتوای دوره دسترسی پیدا کنید.

همچنین از بخش دوره‌های من، به دوره ثبت‌نامی خود دسترسی خواهید داشت. با کلیک بر روی نام کاربری خود، بخش دوره های من را مشاهده خواهید کرد.
 

در این صفحه با کلیک بر روی آیکن ورود به کلاس، به صفحه دوره منتقل خواهید شد.

در صفحه دوره، لیست جلسات دوره را در منوی سمت راست مشاهده خواهید کرد. به صورت پیش فرض محتوای سرفصل اول از جلسه اول برای شما نمایش داده می‌شود.

دقت کنید زمانی به محتوای سرفصل‌های بعدی در جلسه اول یا جلسات بعدی دسترسی خواهید داشت که بخش های قبلی را مشاهده کرده و بر روی دکمه تأیید و ادامه کلیک کرده باشید در غیر این صورت سیستم اجازه مشاهده سرفصل‌ها و جلسات بعدی را به شما نمی‌دهد.
 

در صورتی که بر روی دکمه تأیید و ادامه کلیک کرده باشید، آیکن تیک در کنار عنوان سرفصل نمایش داده می‌شود که نشان‌دهنده تکمیل محتوای سرفصل فعلی است. در این حالت سرفصل بعدی به شما نمایش داده خواهد شد.

در صورتی که همه سرفصل‌ها را مشاهده کرده باشید و بخواهید دوره را مرور کنید کافی است بر روی عنوان هر جلسه یا سرفصل کلیک کنید. با کلیک بر روی هر سرفصل، محتوای سرفصل را مشاهده خواهید کرد.

پس از اطمینان از تکمیل آموزش خود می‌توانید در آزمون پایان دوره شرکت کنید.

آزمون پایان دوره در صفحه خود دوره و پس از تکمیل مشاهده همه سرفصل‌ها فعال خواهد شد. پس از مشاهده آخرین سرفصل دوره بر روی دکمه تأیید نهایی کلیک کنید.

پس از کلیک بر روی تأیید نهایی، بخش تأیید اطلاعات شخصی و ثبت نهایی و انجام آزمون در انتهای منوی سمت راست قابل مشاهده خواهد بود. در صورت تأیید و تکمیل اطلاعات خود در سایت آموزش و در صورت آمادگی برای شرکت در آزمون، بر روی ثبت نهایی و انجام آزمون کلیک کنید.
*** گفتنی است اطلاعات تأیید شده مستقیماً برای صدور گواهی استفاده می‌شوند؛ بنابراین نیاز است که اطلاعات خود را به صورت دقیق و صحیح وارد کنید.

پس از کلیک بر روی دکمه ثبت نهایی و انجام آزمون، به صفحه آزمون منتقل می‌شوید و می‌توانید یک باربه صورت رایگان در آزمون شرکت کنید.

در حین آزمون از زدن دکمه بازگشت یا بستن صفحه خودداری کنید. پس از پایان پاسخگویی در زمان مجاز آزمون، بر روی ثبت آزمون کلیک کنید.

پس از ثبت موفقیت‌آمیز آزمون، نتیجه آزمون خود را مشاهده خواهید کرد.
 

در صورت عدم قبولی در آزمون، امکان آزمون مجدد وجود دارد. در صورت عدم قبولی در اولین آزمون و شرکت مجدد در آزمون پایان دوره، مبلغ 15 هزار تومان از کیف پول شما کسر خواهد شد.

در صورت وجود مشکل با شماره 09104712036 تماس حاصل فرمایید یا به تلگرام همین شماره پیام دهید.