دوره غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار گرومکس (GROMACS)»

دوره غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار گرومکس (GROMACS)»
 
  • تاریخ درج ۱۴۰۰/۰۶/۲۲
  • تعداد بازدید 2,702
 
موضوع

آموزش غیرحضوری
 
 
امتیاز کاربران

۲ امتیاز از ۵ (۱ رای)

 
 
 

دوره غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار گرومکس (GROMACS)»

نرم‌افزارهای مختلفی در خصوص شبیه‌‍سازی دینامیک مولکولی استفاده می‌شوند؛ نرم‌افزار گرومکس GROMACS یکی از برنامه‌های متن باز و رایگان در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی است.

دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار گرومکس (GROMACS)» با تدریس سرکارخانم مهندس آزاده کردزاده در سایت آموزش فناوری نانو در اختیار کاربران قرار می‌گیرد. این دوره شامل 12 ساعت محتوای آموزشی است و علاقه‌مندان پس از ثبت‌نام در دوره، به محتوای دوره دسترسی خواهند داشت. گفتنی است محتوای دوره از طریق بستر سایت آموزش قابل استفاده است و دسترسی به دوره محدودیت زمانی ندارد. آزمون پایان دوره پس از اتمام مراحل آموزشی و در صفحه دوره برگزار می‌شود و شرکت در آن محدودیت زمانی ندارد. شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد شوند، گواهی پایان دوره فارسی و انگلیسی را دریافت می‌کنند.
دانشجویان رشته‌های شیمی، زیست، بیوشیمی، پزشکی، داروسازی و مهندسی می‌توانند از این دوره استفاده کنند.

لینک زیر جهت ثبت‌نام مستقیم در این دوره آماده شده است:



فصل 1 - شبیه‌سازی مولکولی
1-1- آشنایی با روش‌های شبیه‌سازی مولکولی و اهمیت آن‌ها
2-1- آشنایی با روش دینامیک مولکولی 
3-1- آشنایی با نرم‌افزارهای شبیه‌سازی مولکولی و ویژگی‌های آن‌ها

فصل 2 - نرم افزار گرومکس 
1-2- آشنایی با فضای لینوکس
2-2- آموزش نصب نرم‌افزار گرومکس

فصل 3 - شبیه‌سازی پروتئین  در آب 
1-3- آشنایی با فایل‌های ساختاری، ورودی، خروجی نرم‌افزار
2-3- ساخت جعبه شبیه‌سازی و توپولوژی
3-3- حداقل‌سازی انرژی و به تعادل رساندن سیستم
4-3- اجرای شبیه‌سازی و آنالیز
5-3- تحلیل آنالیزها

فصل 4 - شبیه‌سازی سیستم‌های غیرپروتئینی 
1-4- ساخت توپولوژی با استفاده از سرورهای اتوماتیک 
2-4- اصول محاسبات کوانتومی با نرم‌افزار گوسین 
3-4- شبیه‌سازی داروی داکسوروبیسین در آب 
4-4- شبیه‌سازی پلیمر پلی‌اتیلن گلایکول در اتانول 
5-4- شبیه‌سازی نانولوله کربنی در محیط آبی 
6-4- شبیه‌سازی سیستم دوفازی

فصل 5 - آنالیز نتایج 
1-5- اصلاح میدان نیرو
2-5- ساخت غشای دولایه همراه با پروتئین 
3-5- آنالیزهای مربوط به غشای سلول 
4-5- شبیه‌سازی داروی داکسوروبیسین در آب 
5-5- تعیین برهمکنش‌های واندوالس و الکترواستاتیک
6-5- آنالیز تابع شعاعی 
7-5- آنالیز حلال‌پوشی
8-5- محاسبه ضریب نفوذ
9-5- آنالیز ساختاری پروتئین‌ها

فصل 6- شبیه‌سازی دینامیک مولکولی هدایت شده
1-6- آشنایی با نمونه‌گیری چتری 
2-6- اصول شبیه‌سازی هدایت شده 
3-6- مراحل آنالیز نمونه‌‌گیری چتری

 

سرکار خانم مهندس آزاده کردزاده

*** دانشجوی دکتری مهندسی شیمی دانشگاه صنعتی شریف
*** سابقه تدریس آزمایشگاه شیمی فیزیک در دانشگاه صنعتی امیرکبیر و کارگاه‌های آموزشی GROMACS
*** تألیف مقاله ISI در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی نانولوله کربنی عامل‌دار شده به عنوان حامل داروی سرطان
*** پژوهشگر در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی و محاسبات کوانتومی


 


اطلاعات دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار گرومکس (GROMACS)»
 
عنوان دوره شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار گرومکس (GROMACS)
مدرس دوره خانم مهندس آزاده کردزاده
مدت زمان دوره 12 ساعت
نوع محتوای دوره ویدیو، متن و آزمون
مدت زمان ویدیو آموزشی 12 ساعت
زمان دسترسی به محتوای دوره - بلافاصله پس از ثبت‌نام از طریق صفحه رویداد در سایت آموزش
- 24 ساعت پس از پرداخت از طریق زرین پال
مدت زمان دسترسی به دوره نامحدود
نحوه شرکت در آزمون - به صورت آنلاین و پس از گذراندن مراحل آموزشی در صفحه دوره
- بدون محدودیت زمانی
وضعیت گواهی فارسی و انگلیسی
حدنصاب درصد کسب شده در آزمون جهت دریافت گواهی پایان دوره 50 درصد
هزینه دوره 299.000 تومان
هزینه دوره با تخفیف ثبت‌نام زودهنگام: 149.500 تومان
مهلت استفاده از تخفیف  31 شهریور 1400
اطلاعات بیشتر و ثبت‌نام از طریق سایت آموزش ثبت‌نام
ثبت‌نام از طریق زرین پال ثبت‌نام


نکات مهم:
- گواهی پایان دوره الکترونیک، بلافاصله پس از کسب حدنصاب در آزمون در سایت و از طریق بخش رویدادهای من قابل مشاهده و دریافت است.
- گواهی چاپ شده یک ماه پس از برگزاری آزمون و کسب حدنصاب لازم در آزمون ارسال می‌شود.
- کاربرانی که گواهی چاپ شده را دریافت می‌کنند، اشتراک رایگان یک شماره از آخرین فصلنامه نانو به آن‌ها اختصاص خواهد یافت؛ که همراه با گواهی برای ایشان ارسال خواهد شد.
- محتوای دوره از طریق بستر سایت آموزش قابل استفاده است.

 

ابتدا وارد سایت آموزش فناوری نانو شوید (در صورتی که عضو سایت نیستید، ابتدا در سایت عضو شوید: عضویت در سایت)؛ پس از ورود به سایت، در دوره مدنظر خود ثبت‌نام کنید. برای دسترسی به دوره ثبت‌نامی خود، کافی است وارد سایت شوید و بر روی نام کاربری خود کلیک کنید؛ با ورود به بخش رویدادهای من، به دوره ثبت‌نامی خود دسترسی خواهید داشت.


1- ثبت‌نام از طریق پلتفرم سایت آموزش فناوری نانو:  به سایت آموزش فناوری نانو مراجعه کنید و پس از ثبت‌نام در سایت، از طریق لینک زیر در دوره ثبت‌نام کنید:
 

2- مراجعه به لینک زیر:


علاقه‌مندانی که از طریق لینک پرداخت زرین پال در دوره ثبت‌نام می‌کنند، 24 ساعت پس از ثبت‌نام، دسترسی این افراد به دوره در پلتفرم سایت آموزش ایجاد شده و به اطلاع ایشان خواهد رسید.

برای کسب اطلاعات بیشتر درباره دوره با شماره‌ 09104712036 تماس حاصل فرمایید.

ارسال نظر