بسته جامع شبیه سازی دینامیک مولکولی NAMD VMD LAMMPS
بسته جامع شبیه سازی دینامیک مولکولی NAMD VMD LAMMPS
- تاریخ شروع ۱۴۰۰/۰۸/۲۲
- زمان دوره ۱۸:۰۰
- تعداد شرکت کنندگان ۱۷۱
*** این دوره شامل 18 ساعت محتوای آموزشی (ویدیو و آزمون) است و علاقه‌مندان پس از ثبت‌نام در دوره، به محتوای آموزشی دوره دسترسی خواهند داشت؛ دانشجویان و فارغ‌التحصیلان رشته‌های شیمی، زیست‌شناسی، مواد، فیزیک، فناوری نانو و علاقه‌مندان و پژوهشگران حوزه‌های شبیه‌سازی دینامیک ملکولی می‌توانند از محتوای این دوره برای انجام مطالعات و پژوهش‌های خود استفاده کنند.
*** دسترسی به دوره محدودیت زمانی ندارد و شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد در آزمون پایان‌دوره شوند، گواهی الکترونیکی پایان دوره فارسی و انگلیسی را دریافت می‌کنند.
*** هزینه ثبت‌نام در این دوره 719 هزار تومان است که علاقه‌مندان می‌توانند در دوره ثبت‌نام کنند.
| ردیف | عنوان سرفصل | مدرس |
| 1 | شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD - مقدماتی | مهندس امیر دشتی |
| 2 | شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته | مهندس مهران واعظی |
| 3 | شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار LAMMPS | مهندس مهران واعظی |
| 4 | شبیه‌سازی دینامیک مولکولی- تکمیلی NAMD/VMD & LAMMPS | مهندس مهران واعظی |
1- مقدمات
*** مفاهیم اولیه (سیستم، تأیید و اعتبارسنجی سیستم‌های شبیه‌سازی، الگوریتم ریاضی حل سیستم‌ها و ...)
*** مقیاس شبیه‌سازی (ابعادی و زمانی)
*** صول شبیه‌سازی دینامیک مولکولی – شبیه‌سازی دینامیک مولکولی کلاسیک
2- آماده‌سازی فایل‌های ورودی (فایل مختصات PDB، فایل توپولوژی، فایل توصیف ساختاری PSF ، فایل پارامتری و ....)
3- کار با نرم‌افزار و بررسی چند مثال
*** راه‌اندازی نرم‌افزار
*** انبساط گاز CO2
*** شبیه‌سازی قطره آب H2O و بررسی تحرکات حرارتی
شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته
1- آشنایی با کاربردهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
2- آشنایی با مبانی شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
3- آموزش نرم‌افزار VMD
4- آموزش طراحی کانال غشایی توسط نرم‌افزار VMD
5- آموزش پیاده‌سازی شبیه‌سازی با استفاده از نرم‌افزار NAMD
6- آموزش نحوه استخراج داده‌های خروجی و نحوه تحلیل داده‌ها
7- آموزش شبیه‌سازی SMD
8- بررسی عبور یون از کانال پروتئینی توسط شبیه‌سازی SMD
9- تحلیل داده‌های خروجی و محاسبه تغییرات انرژی آزاد
شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار LAMMPS
1- مبانی شبیه‌سازی با نرم‌افزار لمپس (قابلیت‌های نرم‌افزار LAMMPS، میدان‌های نیرو و پتانسیل‌ها، معرفی مفهوم atom style در نرم‌افزار لمپس، معرفی سیستم یکاها در لمپس، مفهوم جعبه شبیه‌سازی و شرایط مرزی، معرفی آنسامبل‌ها، کمینه‌سازی انرژی پتانسیل)
2- نصب نرم‌افزار و آموزش اجرای موازی و سری شبیه‌سازی
3- آموزش شبیه‌سازی سیستم‌های غیر زیستی(شبیه‌سازی نانو-ایندنتیشن کریستال طلا با پروب الماس)
4- آموزش شبیه‌سازی سیستم‌های زیستی(شبیه‌سازی برهمکنش نانوذره طلا و غشای سلولی)
شبیه‌سازی دینامیک مولکولی NAMD/VMD&LAMMPS - تکمیلی
1- معرفی بانک‌های پروتئینی مختلف
2- طراحی توالی DNA و RNA دلخواه
3- طراحی غشاهای زیستی مختلف
4- آموزش نرم‌افزار Nanotube builder به منظور ساخت نانوتیوب و ساختارهای دو بعدی از جنس‌های متفاوت
5- آموزش نرم‌افزار ATOMSK به منظور ایجاد ساختارهای کریستالی، پلی کریستال‌ها و پلی کریستال‌های متخلخل
6- آموزش ساخت ستاپ یون‌زدایی به کمک نانوتیوب کربنی با استفاده از نرم‌افزار VMD (طراحی ستاپ یک مقاله علمی)
7- بررسی رفتار نقطه اتصال طلا و نقره در یک نانوسیم به کمک نرم‌افزارهای ATOMSK ، LAMMPS و MATLAB (بررسی یک مقاله علمی از مرحله طراحی تا پردازش داده‌های خروجی)
* دانشجوی دکتری فناوری نانو در پژوهشکده علوم و فناوری نانو دانشگاه صنعتی شریف
* فارغ‌التحصیل کارشناسی و کارشناسی ارشد فیزیک از دانشگاه صنعتی شریف
* سابقه تدریس نرم‌افزارهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (NAMD و LAMMPS) در دانشگاه شریف
* سابقه پژوهشی در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
جناب آقای مهندس امیر دشتی
* کارشناسی ارشد مهندسی مواد گرایش استخراج فلزات از دانشگاه صنعتی شریف و دانشجوی دکتری مهندسی مواد پژوهشگاه مواد و انرژی
* مدرس دانشگاه
* تدریس، پژوهش و چاپ مقالات علمی در زمینه شبیه‌سازی با نرم‌افزارهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی، کوانتومی و ....
* تدریس، پژوهش و چاپ مقالات علمی در زمینه خوردگی، حفاظت و استخراج مواد
همچنین علاوه بر لینک فوق، می‌توانید ابتدا وارد سایت شوید و از طریق بلیط زیر در دوره ثبت‌نام کنید.
در صورت وجود مشکل با شماره 09104712036 تماس حاصل فرمایید یا به تلگرام همین شماره پیام دهید.
تصویر نمونه گواهی‌های پایان‌دوره در ادامه قابل مشاهده است:
دسترسی نامحدود به دوره عدم محدودیت زمانی برای شرکت در آزمون(در ارتباط با شرکت در آزمون پایان‌دوره به نکات زیر دقت فرمایید:
- ترجیحا از سیستم/کامپیوتر و مرورگر فایرفاکس استفاده کنید.
- در حین آزمون، صفحه را رفرش نکنید و دکمه Back را نزنید.
- تب دیگری را در حین آزمون باز نکنید.
- هیچ آزمونی تحت عنوان آزمون آزمایشی وجود ندارد و در صورت کسب قبولی بالای 50% سیستم بطور خودکار بسته خواهد شد.
- تنها اولین آزمون شما، رایگان است و 4 بار دیگر امکان آزمون مجدد را خواهید داشت که با پرداخت هزینه همراه است.)
ارائه گواهی الکترونیکی به صورت فارسی و انگلیسی پس از اتمام موفقیت آمیز دوره امکان مشاهده دوره آموزشی بلافاصله پس از پرداخت از طریق کیف پولبلیط بسته جامع شبیه سازی دینامیک مولکولی NAMD VMD LAMMPS
| # | ثبت نام | عنوان | قیمت - تومان |
|---|---|---|---|
| 1 | ثبت نام | بسته جامع شبیه‌سازی دینامیک مولکولی «NAMD/VMD&LAMMPS» | قیمت کل : ۷۱۹,۰۰۰ |
